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细菌基因组de novo测序

细菌全基因组从头测序（Bacterial Whole Genome de novo Sequencing ），是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种，构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定，然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释，从而获得该细菌的全基因组序列图谱。
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细菌全基因组重测序

细菌全基因组重测序（Bacterial Whole Genome Resequencing），是指对有参考基因组的细菌个体或群体进行高通量测序（待测菌株与参考基因组的序列相似性 ≥ 98%），将测序数据比对至参考基因组上，获得细菌个体或群体相对于参考基因组的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列变异信息。
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真菌基因组de novo测序

真菌全基因组从头测序（Fungi Whole Genome de novo Sequencing），是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种，构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定，然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释，从而获得该真菌的全基因组序列图谱。
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真菌基因组重测序

真菌全基因组重测序（Fungi Whole Genome Resequencing），是指对有参考基因组的真菌个体或群体进行高通量测序（待测菌株与参考基因组的序列相似性 ≥ 98%），将测序数据比对至参考基因组上，获得真菌个体或群体相对于参考基因组的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列变异信息。
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病毒基因组测序

病毒（Virus）由一种核酸分子（DNA或RNA）与蛋白质（Protein）构成或仅由蛋白质构成（如 朊病毒）。根据遗传物质的组成，可分为单链 DNA 病毒（ssDNA）、双链 DNA 病毒（dsDNA）、单链 RNA 病毒（ssRNA）、双链 RNA 病毒（dsRNA）和蛋白质病毒（如朊病毒）。
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线粒体&叶绿体基因组测序

线粒体&叶绿体基因组测序，是指采用利用二代/三代测序平台，对动植物线粒体和植物叶绿体进行高通量测序，通过高深度测序和生物信息分析，获得线粒体&叶绿体基因组的序列、编码基因、遗传进化等相关信息。
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质粒&BAC克隆子基因组测序

质粒 & BAC克隆子的全基因组测序，是指基于第二代高通量测序技术和/或第三代单分子测序技术，对质粒或 BAC 克隆子的全基因组进行测序、拼接，利用生物信息分析手段，基于测序深度、GC 含量以及序列比对结果，挑选质粒或 BAC 克隆子的全基因组序列。
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动植物基因组de novo测序

基因组从头测序（de novo sequencing），主要针对基因组序列未知或参考基因组组装不理想的物种，构建不同类型的基因组DNA文库，并进行序列测定。
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遗传变异检测

利用高通量测序技术对某一物种或群体的基因组进行测序，通过与参考基因组进行比较，获得该物种或群体在全基因组范围内的遗传变异信息（SNP、InDel、SV、CNV）等，建立遗传多态性数据库，为后续揭示进化关系、功能基因挖掘等研究奠定基础。
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BSA性状定位

BSA（Bulked Segregant Analysis）：称为混合分组分析法，是一种利用极端性状进行功能基因定位的一种方法。
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遗传图谱构建

遗传图谱（Genetic map）又称遗传连锁图谱（Genetic linkage map），是分子标记在染色体上的排列顺序与相对距离的线形图。
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群体进化

利用全基因组重测序或简化基因组测序（dd-RAD）技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息，通过与参考基因组比对或聚类分析的方法得到大量变异信息，基于SN P信息讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题。
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