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菌群多样性组成谱测序

菌群多样性组成谱测序以细菌 / 古菌 16S rRNA 基因可变区、真菌 18S rRNA 基因可变区或真菌 ITS（Internaltranscribed spacer）内转录间隔区等微生物特征序列（Signature sequence）为靶点......
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标记基因全长测序

以PacBio公司的RS II和最新的Sequel测序系统为代表的第三代测序技术，通过SMRT单分子实时测序技术（Single molecule real-time sequencing），可以对DNA序列实现单分子级别的超长读长测序，因而能够轻易读取微生物的rRNA基因/ITS全长序列，不再受制于短序列的局限性，更全面的揭示物种多样性
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扩增子/功能基因测序

借助合适的类群特异性引物，可以检测菌群中特定种类 / 功能微生物的特征序列，反映菌群中该特定类群微生物的组成结构，从而发现它们的分布特征，阐明样本间多样性和组成差异，进而揭示该类群微生物中与差异相关联的关键成员。
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宏转录组测序

宏转录组学（Metatranscriptomics）的研究对象是微生物组mRNA，在获取微生物组总RNA并去除rRNA之后，反转录为cDNA，并构建合适长度的插入片段文库，对这些文库进行双端（Paired-end，PE）高通量测序，从而能精确定量整个菌群中具有活性的物种精细组成及其对应功能的表达水平，进而锁定菌群中的关键生物标记物、阐明其生物学意义。
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宏基因组测序

宏基因组学 (Metagenomics) 研究通过全基因组鸟枪法 (Whole Genome Shotgun， WGS) 测序策略，将提取获得的微生物组总 DNA 随机打断为短片段，并构建合适长度的插入片段文库，对这些文库进行双端 (Paired-end， PE) 高通量测序，从而能全面精细地展示整个菌群的功能代谢谱和物种精细组成谱，进而在组成和功能水平分别挖掘关键生物标记物，从原理上阐明微生物群落在生态系统中发挥作用的根本机制。
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