利用全基因组重测序或简化基因组测序（dd-RAD）技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息，通过与参考基因组比对或聚类分析的方法得到大量变异信息，基于SN P信息讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题。
群体进化研究可以获取物种的变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。探究群体进化可以为动植物遗传育种和濒临灭绝的动植物保护等提供理论依据，同时也可以为地球地质、生态、气候、历史人类活动变化的研究提供生物学佐证。
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