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微生物基因组
细菌基因组de novo测序
细菌全基因组从头测序(Bacterial Whole Genome de novo Sequencing ),是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定,然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释,从而获得该细菌的全基因组序列图谱。
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细菌全基因组重测序
细菌全基因组重测序(Bacterial Whole Genome Resequencing),是指对有参考基因组的细菌个体或群体进行高通量测序(待测菌株与参考基因组的序列相似性 ≥ 98%),将测序数据比对至参考基因组上,获得细菌个体或群体相对于参考基因组的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列变异信息。
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真菌基因组de novo测序
真菌全基因组从头测序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定,然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释,从而获得该真菌的全基因组序列图谱。
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真菌基因组重测序
真菌全基因组重测序(Fungi Whole Genome Resequencing),是指对有参考基因组的真菌个体或群体进行高通量测序(待测菌株与参考基因组的序列相似性 ≥ 98%),将测序数据比对至参考基因组上,获得真菌个体或群体相对于参考基因组的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列变异信息。
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病毒基因组测序
病毒(Virus)由一种核酸分子(DNA或RNA)与蛋白质(Protein)构成或仅由蛋白质构成(如 朊病毒)。根据遗传物质的组成,可分为单链 DNA 病毒(ssDNA)、双链 DNA 病毒(dsDNA)、单链 RNA 病毒(ssRNA)、双链 RNA 病毒(dsRNA)和蛋白质病毒(如朊病毒)。
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线粒体&叶绿体基因组测序
线粒体&叶绿体基因组测序,是指采用利用二代/三代测序平台,对动植物线粒体和植物叶绿体进行高通量测序,通过高深度测序和生物信息分析,获得线粒体&叶绿体基因组的序列、编码基因、遗传进化等相关信息。
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质粒&BAC克隆子基因组测序
质粒 & BAC克隆子的全基因组测序,是指基于第二代高通量测序技术和/或第三代单分子测序技术,对质粒或 BAC 克隆子的全基因组进行测序、拼接,利用生物信息分析手段,基于测序深度、GC 含量以及序列比对结果,挑选质粒或 BAC 克隆子的全基因组序列。
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