真菌基因组de novo测序

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真菌基因组de novo测序

真菌全基因组从头测序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定,然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释,从而获得该真菌的全基因组序列图谱。



产品参数


1、简单真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且杂合度 ≤ 0.5%且基因组 ≤ 40 Mb 

2、复杂真菌:G+C% > 65%  G+C% > 35%或杂合度 > 0.5%或基因组 > 40 Mb 

   Contig N50:将组装得到的 Contig  按序列长度从长到短排序并依次累加,当累加长度正好达到序列总长度  50%  时,最后一条序列的长度。