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全基因组关联分析
全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是一种在某一特定群体中研究遗传突变和表型之间的相关性的方法。
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SSR分子标记开发
微卫星 (Microsatellite) 又称小串联重复 (Short Tandem Repeats, STRs)(Simple Sequence Repeats, SSR)。在各种真核生物基因组中,分布广且比较均匀。
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全外显子组测序
对人类、小鼠等模式生物,可进行全外显子组测序。以人为例,在人基因中大约有 180,000 个外显子,占人类全部基因组的 1%,大约包含 85% 的致病突变。
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人基因组重测序
全基因组测序可全面挖掘DNA水平的遗传变异,包括较大的结构变异。测序周期短,有效数据覆盖均一,可用于拷贝数变异和结构变异的检测、融合基因检测、病毒整合位点检测、非编码区突变检测。
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目标区域捕获测序
目标区域测序是针对研究者感兴趣的基因组序列,通过定制目标区域的探针,与基因组进行杂交, 将目标区域DNA富集后进行高通量测序。
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全长转录组测序
基于PacBio三代测序平台的全长转录组测序,可直接获取mRNA全长序列,更为精准地解读mRNA结构信息,重点关注基因的可变剪切、融合基因等。
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菌群多样性组成谱全长测序
基于PacBio三代测序平台,能够轻而易举地读取群落微生态系统中所有微生物的rRNA基因/ITS全长序列,不再受制于短序列的局限性,并充分保障全长序列的测序精确性,从而在种甚至菌株等精细水平更全面更深入地解析菌群多样性和组成谱。
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动植物基因组全长测序
De novo测序,即从头测序,是指为了获得该物种完整的基因组序列图谱,构建不同长度的DNA片段文库进行序列测定,然后用生物信息学方法对片段进行拼接、组装和注释。
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细菌全基因组从头测序
细菌完成图测序是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组文库,基于 PacBio第三代单分子测序技术结合第二代高通量测序技术,对这些文库进行序列测定,利用生物信息学方法进行拼接,获得完整的染色体及质粒序列,解析编码信息和表观遗传修饰信息。
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真菌近完成图测序
真菌近完成图测序是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库,采用第三代单分子测序技术结合第二代高通量测序技术对文库进行序列测定,然后利用生物信息学方法进行组装和注释,从而获得该真菌的全基因组和甲基化组。
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SSR / STR微卫星标记验证
微卫星(microsatellite analysis)即短串联重复序列(Short tandem repeat,STR),是由几个碱基对作为核心单位,串联重复形成的一类DNA序列,由于核心单位重复数目的变化,构成了STR基因座的遗传多态性。
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物种鉴定
DNA技术以其几乎可以对所有的生物类材料进行鉴定而被广泛应用于动植物物种鉴定。DNA技术鉴定动植物物种是物种识别中发展最快、准确率最高的技术手段。动物种属鉴定是基于动物mtDNA中的保守序列COI和植物cpDNA中的保守序列rbcL或matK的PCR扩增和测序,将测序结果与公共数据库中的已知序列进行比较后,判定动植物种类,讲未知物种划分到属或种。所以DNA种属鉴定将极大地促进人类监测、了解及利用生物多样性的能力,在生命科学、法医学、流行病学、医药、食品质量控制等社会经济领域具有广泛的应用前景。
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