真菌全基因组重测序(Fungi Whole Genome Resequencing),是指对有参考基因组的真菌个体或群体进行高通量测序(待测菌株与参考基因组的序列相似性 ≥ 98%),将测序数据比对至参考基因组上,获得真菌个体或群体相对于参考基因组的 SNP、InDel、CNV 和 SV 等一系列变异信息。