微卫星 (Microsatellite) 又称小串联重复 (Short Tandem Repeats, STRs)(Simple Sequence Repeats, SSR)。在各种真核生物基因组中,分布广且比较均匀。平均每 6 kb 长度中就有 1 个微卫星位点 (Beckmann & Weber, 1992)。但随着每个重复单位碱基长度的增加,微卫星位点的总数减少。具有突变速率快、多态性高等特点。
SSR 分子标记开发是指对多个混合样品的全基因组 DNA 构建基因组文库,利用探针,采用磁珠富集法富集得到SSR 的核心区域及两端的保守序列区域,采用第二代高通量测序平台对文库进行序列测定,利用生物信息学的分析方法获得具有多态性的 SSR 序列并设计引物。
◇ 遗传图谱构建 ◇ 种质鉴定 ◇ 遗传多样性分析 ◇ 基因定位 ◇ 数量性状基因座(QTL)分析
